Bioinformata Pleno

Cidacs Plataforma de Dados
📍 Salvador - BA Publicado 02/12/2025 Área: Bioinformata

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Sobre a vaga

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Você é um(a) bioinformata com mais de 3 anos de experiência, alta autonomia, capacidade de liderar soluções complexas e maturidade técnica para tomar decisões informadas em ambientes computacionais de alto desempenho com responsabilidade?

Local

Salvador - BA

Presencial

Responsabilidades

  • Desenho e implementação de pipelines de bioinformática: Projetar pipelines reprodutíveis (pré-processamento, alinhamento, chamadas de variantes, gVCF, joint-calling) utilizando containers e seguindo melhores práticas internacionais (GATK Best Practices, nf-core).
  • Definir painéis/métricas de QC: Estabelecer métricas de qualidade para sequências (FASTQ/BAM/VCF) e metadados clínico-fenotípicos, definindo thresholds, alertas e relatórios.
  • Automatização: Desenvolver rotinas automatizadas para ingestão, auditoria e curadoria, garantindo eficiência, padronização e rastreabilidade.
  • Consolidar catálogos e metadados: Apoiar a construção de catálogos agregados de variantes (frequências populacionais), indexação e versionamento de metadados conforme ontologias reconhecidas (HPO, SNOMED-CT, OMOP, GA4GH).
  • Procedimentos Operacionais Padrão (SOPs): Elaborar documentos técnicos, guias e templates para garantir governança, auditoria e reprodutibilidade dos processos.
  • Documentação robusta: Criar e manter documentação completa e clara, garantindo que pipelines e procedimentos possam ser mantidos, auditados e evoluídos pela equipe no futuro.

Requisitos

  • Mestrado em Bioinformática ou áreas correlatas envolvendo ciências da saúde, biologia computacional, genética, ciência de dados biomédicos ou informática aplicada à genômica humana.
  • Mínimo de 3 anos em bioinformática (acadêmica ou profissional), com atuação comprovada em genômica.
  • Experiência sólida no desenho, implementação, operação e otimização de pipelines reprodutíveis (pré-processamento, mapeamento, chamadas de variantes, joint-genotyping etc.).
  • Participação prévia como bioinformata em projetos de genômica.
  • Experiência prática com Nextflow e/ou WDL/Cromwell, incluindo execução em ambientes HPC.
  • Domínio de ferramentas essenciais: GATK, BWA, samtools/bcftools, Picard.
  • Uso de ontologias biomédicas (HPO, SNOMED, OMOP) ou experiência em mapeamento de metadados clínicos.
  • Experiência com containers (Docker, Singularity/Apptainer).
  • Vivência em QC e curadoria de dados genômicos.
  • Conhecimento de ambientes HPC (SLURM, filas, quotas, logs, storage distribuído).
  • Sólida experiência em Linux e Shell Script.
  • Experiência com Git, versionamento, CI/CD e boas práticas de engenharia de software.
  • Abordagem analítica e orientada à solução de problemas.
  • Capacidade de trabalhar em ambiente colaborativo e de alta responsabilidade científica.

Diferenciais

  • Doutorado em Bioinformática ou áreas correlatas.
  • Publicações científicas relevantes em genômica ou bioinformática.
  • Experiência prévia em projetos nacionais ou multicêntricos de grande escala.
  • Experiência com pipelines nf-core, HAIL ou Spark genômico.
  • Conhecimento de processamento em GPU e Nvidia Parabricks em genômica.

Sobre a empresa

O Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para Saúde (Cidacs/Fiocruz Bahia) está recrutando um(a) Bioinformata Pleno para atuar no Piloto do Repositório Nacional de Dados Genômicos do Programa Genomas Brasil, projeto prioritário do Ministério da Saúde/DECIT.

Nos próximos 24 meses, vamos transformar milhares de sequências genômicas dispersas em um repositório nacional vivo, seguro e interoperável — com pipelines Nextflow/WDL executando em HPC, controle de qualidade rigoroso e metadados harmonizados.

Estamos construindo o primeiro piloto do Repositório Nacional Genômico, integrando dados genômicos, fenotípicos e clínicos provenientes de projetos financiados pelo DECIT/MS, criando a base para pesquisas em saúde pública, vigilância genômica e medicina de precisão.

O CIDACS é um centro pioneiro na integração de dados, focado em entender, estudar e avaliar as condições de saúde da população brasileira por meio de Big Data.

Nosso trabalho auxilia gestores públicos, pesquisadores e a comunidade, contribuindo para transformar vidas.

Se você, assim como nós, é apaixonado por tecnologia e inovação, junte-se ao nosso time.

Aqui, você encontrará um ambiente acolhedor, propício para desenvolvimento e inovação, repleto de profissionais de diversas formações acadêmicas unidos por um propósito.

Aqui você encontrará: Um ambiente acolhedor e colaborativo; Profissionais altamente qualificados e multidisciplinares; Infraestrutura de ponta (HPC, data lake seguro, TRE); Incentivo à inovação, formação contínua e autonomia científica.